本研究中心轄有試驗林地460公頃，位於海拔576-925公尺之間，年平均氣溫21℃，年平均雨量2,200公厘(毫米)，其中269公頃為中部低海拔地區僅存最完整之天+6然闊葉樹林；182公頃人工林則以杉木為主，少數為香杉或肖楠。位於蓮華池地區轄下之建築設施包含有：辦公廳舍、生態教育館、肖楠木屋、森林探索學堂、后崙苗圃、藥用植物標本園等。此外，本中心轄下另有畢祿溪工作站位於梨山附近，海拔2100-3370公尺，屬溫帶性氣候，為天然針葉林與針闊葉林之森林植群，從事中部高山試驗集水區水文及中高海拔森林生態之相關研究。
自然資源部分，蓮華池試驗林具有豐富的生物種類，目前蓮華池區內之動植物相調查，計有維管束植物177科，561屬，879種；野生鳥類78種、蝶類131種，兩棲類之蛙類24種、蜥蜴類10種、爬蟲類11種、哺乳類20種、大型真菌約384種。