哺乳動物
陸象豫等 (2010) 的研究於福山試驗林哈盆溪濱水帶記錄到至少16科22種哺乳動物，其中食肉目及偶蹄目動物之種類及數量均相當豐富，而囓齒目鼠科動物較少。
鳥類
根據2007年的調查資料，共記錄31種鳥類，山坡森林 (HMF) 及溪谷芒草 (HSG) 分別為22種及24種 (葛兆年，2008)。
兩棲爬行類
- 福山試驗林內有記錄的兩棲類共有5科19種：在靜止水域附近活動的青蛙至少有11種，而流動水域附近則有8種 (毛俊傑，2010)。
- 爬行類動物9科20種。福山地區蛇類至少有16種 (長期監測站共記錄到14種蛇)，其中以赤尾青竹絲的數量最多 (毛俊傑，2010)。
魚類
根據哈盆溪流域進行之魚類研究結果，共記錄有6種魚類，1種蝦類、1種貝類。魚類依相對數量之大小分別為臺灣鏟頜魚 (Varicorhinus barbatulus)、臺灣馬口魚 (Zacco barbata)、臺灣纓口鰍 (Crossostoma lacustre )、褐吻鰕虎 (Rhinogobius brunneus)、沙鰍 (Cobitis taenia) 以及臺灣石𩼧 (Acrossocheilus paradoxus)(林曜松，1997；林曜松，1999)。
昆蟲
珍貴昆蟲：哈盆地區較為珍貴之昆蟲種類，在蜻蛉目中有無霸勾蜓 (Anotogaster sieboldii)；鞘翅目中之妖艷吉丁蟲 (Buprestis mirabilis)；而鱗翅目中已採獲而屬於臺灣特有種者有7種：臺灣鳳蝶 (Papilio thaiwanus)、臺灣麝香鳳蝶 (Byasa impediens subsp. febanus)、江崎蛇目蝶 (Ypthima esakii)、大波紋蛇目蝶 (Ypthima conjuncta subsp. yamanakai)、大白條黑蔭蝶 (Lethe mataja)、埔里三線蝶 (Neptis taiwana)及大黑星弄蝶 (Seseria formosana) (楊平世等，1987)。
蛾類：
- 蛾類監測共記錄71種，以溪谷林型的採集效率最低 (葛兆年，2008)。
- 福山試驗林的大型蛾類於1998-1999年間的調查中，共採集蛾類超過24科956種。其中福山大型蛾類含括蠶蛾總科34種 (帶蛾科3種、蠶蛾科6種、枯葉蛾科13種、籮紋蛾科1種、天蠶蛾科11種)、天蛾總科41種 (天蛾科41種)，共計75種 (趙榮台，1999)。
蜻蜓：從2006年4月至10月的蜻蜓發生季期間，哈盆溪流域總共調查到9科21屬26種蜻蜓目昆蟲，其中以豎翼亞目的豆娘種類較為優勢，依序為短腹幽蟌 (Euphaea formosa)、白痣珈蟌 (Matrona cyanoptera) 及中華珈蟌 (Psolodesmus mandarinus) (葉文琪，2007)。
螞蟻：
- 依據2006年哈盆溪流域調查，由該年3月至10月的掉落式陷阱中，共獲得5科69形態種螞蟻(董景生，2007)。
- 哈盆樣區自2006年至2007年間共17個月採獲5個亞科 (家蟻亞科、山蟻亞科、針蟻亞科、粗角蟻亞科、琉璃蟻亞科) 81種。(葛兆年，2008)。
食屍性甲蟲：2006-2007年間共捕獲7科39種的食屍性甲蟲(葛兆年，2008)。
水棲昆蟲：在哈盆溪上游之水棲昆蟲種類單純，幼蟲以蜉蝣目 (63.68%) 為主，成蟲以蜉蝣目 (33.14%)、毛翅目 (34.52%)、樍翅目 (29.15%) 為最主要之昆蟲種類 (李後晶，1997)。