嘉義研究中心的定位以發展(一)環境林研究與技術服務；(二)植物園特色經營與規劃；(三)加強重要樹種育林與育種之研究等3大項目為重點經營目標，目前提供各試驗林地予研究人員，進行相關學術研究，同時提供大眾各種動植物觀賞、休閒遊憩、解說教育等服務。透過不同專項主題研究、計畫執行發揮植物園及試驗林的功能，並且定期將研究成果進行發表科普化，強化嘉義研究中心的特色與功能與亮點。在各植物園與苗圃的經營管理上將有針對室內與戶外設置具有育苗、展示及保種功能的溫室與展示室。