歷史沿革
行政院農業部林業試驗所轄下之六龜試驗林，為日治時代為京都帝國大學演習林之一部分。日治時期的日本政府，為了戰爭資源需求，在六龜及茂林地區設置了演習林（即目前六龜試驗林），從事金雞樹試驗、栽植及採收相關工作。
臺灣光復後，成立第二模範林場，隸屬於臺灣行政長官公署農林處，民國三十七年九月歸於高雄山林管理所，民國三十八年省府有關金雞納事業部份之林班撥歸臺灣省林業試驗所經營管理，並於同年五月成立六龜金雞納試驗場。往後因奎寧已能由化學合成製造，致金雞納失去市場價值，其有關之試驗研究與繁殖已無需要，於是其業務乃轉為一般林業試驗。為使名實相符，復於民國五十三年五月奉省令改稱為林業試驗所六龜分所，民國八十八年改隸行政院農業委員會。民國112年改稱農業部林業試驗所六龜研究中心迄今。
地理環境簡介
六龜試驗林位於臺灣本島南部，荖濃溪以東，屬荖濃溪流域之一部分。面積9,882公頃，海拔250～2,600公尺間。行政區劃屬於高雄市茂林區、桃源區、六龜區。雨季大致為5~9月，乾季為10~4月。
試驗林因位於中央山脈與荖濃溪之間，故山脈與水系之走向均受中央山脈之影響，濁口溪流貫本區而致形成二個不同走向之地形。一為自中央山脈支脈的卑南主山向西延伸，經石山，溪南山至本區北方邊界的御油山(1,891m)後，主脈繼續向南行，縱貫本區之北部，右支脈至濁口溪為止，左支脈轉向西南行，構成本區東面之界，為本試驗林之北半部(扇平地區)。試驗林之南半部(多納地區)為遙拜山向西延伸，至本區之南端邊界後，分左右二支脈圍成一橢圓形地區。
此外，98年之莫拉克颱風重創南臺灣山區，本試驗林在此颱風過後共發生204處崩塌，整個六龜試驗林崩塌地面積擴增至1860公頃，佔試驗林總面積18.8%;人工林面積1,596.3ha，佔總試驗林地面積 9882.3ha 之 16.2%，包括崩塌面積達198公頃; 天然林佔 7,954.2 公頃，佔試驗林總面積80.5，包括崩塌地面積約1662公頃。無立木地佔 3.3%，計 331.8公頃，包括苗圃、草生地、水域等。
林班狀況
六龜試驗林共劃分為25個林班，轄下計有扇平森林生態科學園(扇平試驗站) (共933公頃)及鳳崗山苗圃、多納苗圃。臺灣光復後的造林樹種多以針葉樹為主，包括臺灣杉、紅檜、香杉、柳杉等針葉樹。由於生育地之生物及環境因素限制，僅臺灣杉較適合於本試驗林生長，故選定臺灣杉為示範經營之對象。除此之外，另著手於針、闊葉混合林及原生貴重闊葉樹如臺灣櫸、牛樟、光蠟樹及樟樹之試驗造林。至民國 100 年底，本中心人工林造林面積累計已達 1,596.3ha，佔總試驗林地面積之 16.2%。
自然資源
本試驗林之闊葉樹林，樹種組成十分安定。因受到夏季高溫多雨，盛行西南季風，冬季乾旱溫和之氣候影響，植物種類複雜，主要的木本植物和地表植物以 樟科和殼斗科為主。
動物及昆蟲資源方面，2011年六龜試驗林濱水帶生態監測研究於六龜中寮與扇平溪從事濱水帶生態監測，結果顯示中寮溪上游集水區的哺乳動物計有11種，分別為臺灣長尾麝鼩、臺灣獼猴、赤腹松鼠、山羌、山豬、食蟹蠓、野兔、刺鼠、鼬獾、長鬃山羊、白鼻心。
高雄市野鳥協會2010年紀錄扇平的鳥種達134種以上，其中留鳥佔臺灣地區2/3，可觀察到珍貴稀有鳥類包括：臺灣藍鵲、朱鸝、花翅山椒鳥、八色鳥、壽帶鳥、綠啄花、黃羽鸚嘴、黃山雀、藍腹鷴、林鵰。
扇平地區的蝶類種類在張乃航、陳永修1988年「扇平蝴蝶生態圖誌」中記錄5科139種；蛾類則由張玉珍、范義彬、沈勇強1992年「扇平地區蛾類其取食植物名錄」中記錄25科374種。
研究重點：- 經濟性人工林之發展：本中心定期進行人工林造林地清查，並於107及109年度於12及13林班進行臺灣杉造林地中層及下層疏伐。近年來持續辦理疏伐後之微環境監測作業，以及疏伐木之推廣與加值利用，亦將配合未來本中心木工廠之建立，進行更完整之製材SOP及利用規劃，預期將建立從原料至產品生產端，從森林生態、人工林經營、疏伐作業、林產加工、工藝產品設計到推廣體驗活動等，產銷一條龍的概念，逐步將本中心打造成國產材試驗研究及展示推廣基地。
- 天然林及崩塌地動態樣區監測：六龜試驗林1999~2018年共設立5個動態樣區，面積皆為1 ha，分別為南鳳山臺灣山茶動態樣區、多納林道崩塌地動態樣區、19林班印度栲動態樣區、京大山原始林動態樣區、25林班針闊葉混合林動態樣區。25林班樣區每10年複查1次，於2009年進行第1次複查，原本2019年要進行第2次複查，但由於莫拉克風災後，林道中斷無法通行而無法進行複查。19林班、京大山、臺灣山茶皆為每5年複查1次。至於崩塌地樣區則為每年複查2次(乾、雨季各1次)。
- 臺灣山茶之相關研究：林務局自108年推動林地經營變革，容許林下適度養蜂、段木香菇、栽培金線連等「林下經濟」品項以來，在維繫森林生態的前提下，已創造山村社區及原住民部落周邊綠色產業。本中心於110年起接受林務局屏東林區管理處委辦「臺灣山茶苗木培育計畫」案，已建立臺灣山茶苗木培育技術，提供超過一萬株臺灣山茶苗木以做為推廣林下經濟使用。此外，本中心也持續進行臺灣山茶資源開發利用之相關研究，包含野生山茶之母樹標定、物候觀察、不同海拔山茶化學成分及抗氧化活性之分析等。
- 扇平森林生態科學園之經營管理：扇平森林生態科學園有著多樣的自然資源、豐富的人文史蹟及高評價遊憩性的特性，多年來本著試驗研究及生態保育的原則下經營。本園區為六龜試驗林重要展示窗口，也是南台灣重要的自然教育園區，透過志工之解說，引導民眾以知性、感性與文化涵養的方向體驗森林環境，以落實森林自然生態保育、教育與試驗林相關試驗研究推廣的精神與寓意。